Dopo gli eventi che hanno avuto luogo in Splinter Cell Double Agent, Sam Fisher viene concesso a se stesso. Quelli che ha lavorato in precedenza, hanno dichiarato il nostro eroe al di fuori della legge, così l'ex agente della "terza ondata" di nascosto. Dopo un po ', e Sam scopre che la struttura dello stato del paese più democratico del mondo non è tanto e democraticamente. Favorite NSA crivellato di corruzione, ed ex collega - Anne Grimsdottir, una volta che uno specialista per fornire assistenza tecnica e supporto di comunicazione agenti Splinter Cell «nel settore," un pericolo mortale.